Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms