Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB1P82279 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB1P82279 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB1P82279 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB1P82279 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms