Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMF1P82094 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMF1P82094 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMF1P82094 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMF1P82094 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMF1P82094 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMF1P82094 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms