Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRX1P78414 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRX1P78414 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRX1P78414 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRX1P78414 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRX1P78414 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms