Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RPS29P62273 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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