Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms