Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVS71-1P61550 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms