Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCCD1P59942 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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