Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN15P56746 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN15P56746 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms