Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52P55327 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms