Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms