Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DAP3P51398 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms