Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LHX2P50458 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX2P50458 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX2P50458 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX2P50458 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms