Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms