Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PXNP49023 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PXNP49023 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PXNP49023 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PXNP49023 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PXNP49023 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PXNP49023 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PXNP49023 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PXNP49023 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PXNP49023 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms