Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms