Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms