Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA9P31269 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms