Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms