Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLD1P28340 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms