Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms