Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms