Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms