Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms