Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSSP25774 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms