Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms