Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms