Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms