Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LMNB1P20700 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms