Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRHP20396 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRHP20396 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRHP20396 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRHP20396 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRHP20396 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRHP20396 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRHP20396 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRHP20396 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRHP20396 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRHP20396 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRHP20396 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRHP20396 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRHP20396 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRHP20396 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRHP20396 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRHP20396 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRHP20396 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms