Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDSP20132 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SDSP20132 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDSP20132 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDSP20132 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDSP20132 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDSP20132 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDSP20132 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDSP20132 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDSP20132 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDSP20132 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDSP20132 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDSP20132 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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