Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PTPRAP18433 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PTPRAP18433 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PTPRAP18433 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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PTPRAP18433 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PTPRAP18433 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRAP18433 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRAP18433 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRAP18433 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRAP18433 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRAP18433 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
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