Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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