Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C1P13056 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms