Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJB1P08034 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJB1P08034 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJB1P08034 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJB1P08034 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJB1P08034 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJB1P08034 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB1P08034 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB1P08034 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB1P08034 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB1P08034 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB1P08034 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB1P08034 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB1P08034 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB1P08034 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB1P08034 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms