Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEFLP07196 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NEFLP07196 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEFLP07196 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEFLP07196 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms