Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms