Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms