Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRODHO43272 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRODHO43272 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRODHO43272 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRODHO43272 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRODHO43272 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRODHO43272 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRODHO43272 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRODHO43272 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRODHO43272 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRODHO43272 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRODHO43272 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRODHO43272 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRODHO43272 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRODHO43272 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRODHO43272 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms