Protein–RNA interactions for Protein: O15145

ARPC3, Actin-related protein 2/3 complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC3O15145 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC3O15145 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC3O15145 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms