Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms