Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F3O00716 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F3O00716 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F3O00716 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms