Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms