Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H7C1D1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H7C1D1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H7C1D1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
H7C1D1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
H7C1D1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
H7C1D1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
H7C1D1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
H7C1D1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
H7C1D1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H7C1D1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H7C1D1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H7C1D1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H7C1D1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H7C1D1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H7C1D1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H7C1D1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H7C1D1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms