Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF839A8K0R7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms