Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms