Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
A4D1N5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
A4D1N5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms