Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VWA8A3KMH1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms