Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC144AA2RUR9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC144AA2RUR9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms