Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K4Q9Y6R4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms